南京愛爾眼科醫院
南京愛爾眼科醫院是國內最大的專業眼科機構——愛爾眼科集團旗下的連鎖醫院之一。醫院集醫療、教學、科研、保健和防盲治盲為一體，完全按照國家三級醫院標準進行建設，建筑面積一萬多平方米，設有40多間各種類型診室以及10間具國際標準的層流手術室，是目前江蘇地區規模最大、設備最為精良的眼病專科醫院。
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南京醫科大學第二附屬醫院
南京醫科大學第二附屬醫院（又名南京醫科大學第二臨床醫學院、江蘇省第二紅十字醫院、南京醫科大學附屬兒童醫院）是江蘇省衛生廳直屬三級甲等綜合性醫院和南京醫科大學臨床教學基地；是衛生部消化內鏡診療培訓基地和衛生部全科醫師培訓基地。
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南京醫科大學第二附屬醫院婦產科
南京醫科大學第二附屬醫院婦產科擁有較強的臨床、科研、教學實力，擁有一支醫德高尚、醫術精湛、力量雄厚、臨床經驗豐富的人才隊伍。婦產科是南京醫科大學碩士學位點，參與臨床醫學院、兒科醫學院、康達醫學院、成人教育學院、護理學院的教學工作。每年有多名省內外的進修醫生在我科接受培訓。
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南京市婦幼保健院
南京市婦幼保健院（南京醫科大學附屬南京婦幼保健院、國家級愛嬰醫院、江蘇省首家三級甲等婦幼保健院）創建于1936年，前身為國立中央高級助產職業學校附屬產院。歷經71年風雨，在幾代人的奮發努力下，該院規模不斷擴大，業務迅速發展，已成為集婦女兒童保健、醫療、教學、科研為一體的、在社會上享有盛譽的市級婦幼保健院。
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南京市第二醫院
南京市第二醫院，又名東南大學附屬第二醫院，由宋美齡基金會創建于1933年，有77年歷史。南京市腫瘤醫院、南京市老年病醫院與我院合署，南京市腫瘤防治辦公室也設在我院。醫院專業設施完善，技術力量雄厚，醫療設備先進，是集醫療、教學、科研為一體的江蘇省三級甲等醫院。
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南京市中西醫結合醫院
南京市中西醫結合醫院（南京市鐘山醫院）是一所集醫療、教學、科研、預防、保健為一體的市級綜合性醫院，醫院是南京市惠民醫療單位，愛嬰醫院，南京中醫藥大學、安徽中醫學院的教學醫院，意大利都靈BOSCO醫院友好合作醫院，江蘇省中西醫結合學會外治法研究中心、南京中西醫結合學會、南京市糖尿病防治中心分中心、南京市第一醫院外科分中心、南京市兒童醫院城東分院所在地，醫院實施了ISO9001質量管理體系并獲得BSI英國標準協會的審核認證。
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長征醫院南京分院
第二軍醫大學長征醫院南京分院設有臨床科室25個，醫技科室15個，開展41個專業，14個實驗室，8個診療中心：創傷急救中心、腦復蘇中心、血液凈化中心、聽力康復和眩暈治療中心、肝病中心、整形美容中心、口腔中心、體檢中心。
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南京市浦口區中心醫院
南京市浦口區中醫院位于南京市浦口區珠江鎮城北路109號，全院占地面積9248平方米，始建于1998年，是一所具有醫療、教學、科研能力的二級乙等綜合性中醫院。
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南京醫科大學附屬眼科醫院
南京醫科大學眼科醫院系南京醫科大學附屬眼科醫院，江蘇省紅十字眼科醫院，隸屬于南京醫科大學第四臨床醫學院，是在原中日友好南京眼科醫院的基礎上創建的融醫療、教學、科研于一體、與國際接軌的高精尖眼科專科非營利性醫院，是江蘇省公費醫療、南京市公費醫療及江蘇省、南京市城鎮職工和居民醫保定點眼科專科醫院，為江蘇省驗光配鏡從業人員實訓考核基地，江蘇省中小學生眼保健教育示范基地，南京醫科大學碩士生培養基地，擁有中央與地方共建高校特色優勢學科實驗室——南京醫科大學醫學視光學教學實驗室。
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南京同仁醫院
南京同仁醫院是由北京同仁醫院控股的同仁醫療管理集團和江寧經濟技術開發區共同投資興建的一家國有控股的股份制醫院。醫院按國家三級甲等綜合性醫院標準建造，是集醫療、預防、保健、康復、家庭護理、科研教學、國際交流、健康生活于一體的花園式醫療保健中心。醫院于2003年12月開工建設，2007年6月建成，于2007年10月8日正式開業。
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